Comment calculer la probabilité du graphique de densité?

Vos données ne sont pas incluses dans la question, alors constituons un petit échantillon aléatoire:

library(ggplot2)

set.seed(69)

df <- data.frame(x = rnorm(10))

Maintenant, nous pouvons créer un graphique de densité selon votre exemple:

p <- ggplot(df, aes(x)) + 
  geom_density() +
  xlim(c(-5, 5))

p

Maintenant, nous pouvons en fait trouver les coordonnées x et y de cette ligne en utilisant la fonction de base R densityet en extrayant ses composantes x et y dans un bloc de données:

dens <- density(df$x)
d    <- data.frame(x = dens$x, y = dens$y)

head(d)
#>           x            y
#> 1 -3.157056 0.0009453767
#> 2 -3.144949 0.0010145927
#> 3 -3.132841 0.0010870523
#> 4 -3.120733 0.0011665920
#> 5 -3.108625 0.0012488375
#> 6 -3.096517 0.0013382316

Nous pouvons voir le tracé comme un pointillé rouge, geom_linec'est la même chose que geom_density:

p + geom_line(data = d, aes(x, y), col = "red", linetype = 2, size = 2) 

Now suppose we want to know the probability of having a value of more than one. We can show the area we are interested in like this:

p + geom_area(data = d[d$x >= 1,], aes(x, y), fill = "red")

Since the x values are all equally spaced in our data frame d, then the red area's proportion of the area under the line is a simple ratio of the sum of all y values at x values greater than one to the grand sum of y:

sum(d$y[d$x > 1])/sum(d$y)
#> [1] 0.1599931

So the probability of getting an x value of > 1 is 0.15999, or 16%

^{Created on 2020-08-17 by the reprex package (v0.3.0)}